Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mesp1P97309 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mesp1P97309 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms