Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43bP86448 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms