Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElocP83940 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElocP83940 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElocP83940 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElocP83940 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElocP83940 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElocP83940 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElocP83940 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElocP83940 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElocP83940 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ElocP83940 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElocP83940 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms