Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms