Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx1P81068 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms