Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms