Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx1P80205 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms