Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1bP70700 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms