Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf3P70671 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms