Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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