Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms