Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx3P70354 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms