Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms