Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms