Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plxna3P70208 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms