Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms