Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms