Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crnkl1P63154 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crnkl1P63154 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms