Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou3f4P62515 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms