Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufm1P61961 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms