Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms