Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ActbP60710 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ActbP60710 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ActbP60710 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ActbP60710 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms