Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms