Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp3P58854 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms