Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms