Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmoP56726 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmoP56726 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmoP56726 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmoP56726 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmoP56726 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmoP56726 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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