Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TdgP56581 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TdgP56581 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TdgP56581 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TdgP56581 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TdgP56581 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TdgP56581 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TdgP56581 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TdgP56581 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms