Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms