Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtskP55097 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtskP55097 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms