Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms