Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms