Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CnbpP53996 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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