Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PctpP53808 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PctpP53808 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PctpP53808 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms