Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fdft1P53798 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms