Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms