Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dbx1P52950 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Dbx1P52950 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Dbx1P52950 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Dbx1P52950 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dbx1P52950 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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