Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Matn1P51942 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Matn1P51942 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms