Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApodP51910 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApodP51910 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApodP51910 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ApodP51910 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApodP51910 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApodP51910 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApodP51910 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms