Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms