Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TspoP50637 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TspoP50637 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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