Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms