Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms