Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms