Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VdrP48281 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VdrP48281 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms