Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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