Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd4P46935 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms