Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf1P46099 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms