Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msh2P43247 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms