Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms