Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms